MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 plasmid pFPHI01

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010331	TTA	2	6	23	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010331	AAG	2	6	45	50	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010331	AGA	2	6	63	68	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010331	A	6	6	76	81	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010331	AGA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010331	ATT	4	12	137	148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010331	GAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010331	TGA	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010331	GAA	2	6	190	195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010331	ATCC	2	8	251	258	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010331	TA	4	8	266	273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010331	CAA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010331	TCA	2	6	303	308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010331	ATTTT	2	10	323	332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010331	ATA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010331	TGG	2	6	459	464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010331	ATTA	2	8	490	497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010331	TTTA	2	8	498	505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010331	A	8	8	518	525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010331	TC	3	6	526	531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010331	T	6	6	538	543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010331	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010331	GTG	2	6	575	580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010331	CAT	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010331	T	6	6	681	686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010331	GA	3	6	709	714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010331	GCA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010331	AGT	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010331	TGA	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010331	ATA	2	6	1014	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010331	CATAA	2	10	1024	1033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010331	T	7	7	1037	1043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010331	TTTC	2	8	1063	1070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010331	T	6	6	1079	1084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010331	TCTT	2	8	1109	1116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010331	T	6	6	1124	1129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010331	TTC	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010331	T	6	6	1190	1195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010331	GTT	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010331	A	6	6	1296	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010331	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010331	A	7	7	1403	1409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010331	A	6	6	1436	1441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010331	ATA	2	6	1465	1470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626222
45	NC_010331	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626222
46	NC_010331	ATT	2	6	1535	1540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
47	NC_010331	A	7	7	1602	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	167626222
48	NC_010331	CAG	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626222
49	NC_010331	ATT	2	6	1687	1692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
50	NC_010331	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626222
51	NC_010331	ATT	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
52	NC_010331	ATTT	2	8	1861	1868	25 %	75 %	0 %	0 %	167626222
53	NC_010331	ACT	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
54	NC_010331	A	6	6	1974	1979	100 %	0 %	0 %	0 %	167626222
55	NC_010331	ACT	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
56	NC_010331	AG	3	6	1998	2003	50 %	0 %	50 %	0 %	167626222
57	NC_010331	AG	3	6	2092	2097	50 %	0 %	50 %	0 %	167626222
58	NC_010331	CATT	2	8	2105	2112	25 %	50 %	0 %	25 %	167626222
59	NC_010331	TCAA	2	8	2197	2204	50 %	25 %	0 %	25 %	167626222
60	NC_010331	AGA	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626222
61	NC_010331	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	167626222
62	NC_010331	AATG	2	8	2280	2287	50 %	25 %	25 %	0 %	167626222
63	NC_010331	ATT	2	6	2304	2309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626222
64	NC_010331	TAC	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
65	NC_010331	CAT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626222
66	NC_010331	A	6	6	2360	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	167626222
67	NC_010331	TTTG	2	8	2379	2386	0 %	75 %	25 %	0 %	167626224
68	NC_010331	AAAACT	2	12	2413	2424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626224
69	NC_010331	A	6	6	2442	2447	100 %	0 %	0 %	0 %	167626224
70	NC_010331	GTT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626224
71	NC_010331	A	6	6	2476	2481	100 %	0 %	0 %	0 %	167626224
72	NC_010331	ATG	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626224
73	NC_010331	T	6	6	2549	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	167626224
74	NC_010331	TTA	2	6	2571	2576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626224
75	NC_010331	TGA	2	6	2577	2582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626224
76	NC_010331	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626224
77	NC_010331	AGATA	2	10	2645	2654	60 %	20 %	20 %	0 %	167626224
78	NC_010331	T	7	7	2657	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010331	T	8	8	2665	2672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010331	A	6	6	2813	2818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010331	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010331	ATC	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010331	TTTTGA	2	12	3139	3150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010331	TTC	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626223
85	NC_010331	CTTT	2	8	3187	3194	0 %	75 %	0 %	25 %	167626223
86	NC_010331	TAT	2	6	3212	3217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626223
87	NC_010331	T	7	7	3217	3223	0 %	100 %	0 %	0 %	167626223
88	NC_010331	TCT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626223
89	NC_010331	TCA	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626223
90	NC_010331	T	6	6	3355	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	167626223
91	NC_010331	T	9	9	3430	3438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010331	A	7	7	3473	3479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010331	TGA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010331	A	6	6	3561	3566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010331	TAA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010331	ATT	2	6	3587	3592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010331	TTA	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010331	CTTT	2	8	3683	3690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010331	GAAAG	2	10	3721	3730	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010331	ATT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010331	T	7	7	3755	3761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010331	T	8	8	3793	3800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010331	T	6	6	3806	3811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010331	AT	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010331	AT	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010331	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010331	AGA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010331	A	9	9	3889	3897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010331	TAA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010331	A	6	6	3931	3936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.